Probabilmente, visto che hanno due modi diversi di interpretare la Tabella di Partizionamento, Windows o WinPE leggono correttamente lo schema, OS X trova un inizializzazione del Disco che non conosce e di conseguenza non può metterci mano, una parte che in genere Windows “non usa”.
Se lo schema lato MBR Ibrido ecc è diciamo di Default non ci sono problemi, se invece risulta pasticciato posso insorgere questo tipo di problematiche, in genere la Partizione qualsiasi essa sia l'installer di OS X è in grado di formattarla, a meno di quanto detto sopra...