Ciao... quando un hack è configurato a modo mirato ed è stabile, si possono effettuare tranquillamente gli aggiornamenti
Per i portatili l'aggiornamento da non eseguire è quello per EFI firmware, il quale può essere semplicemente ignorato.
Personalmente eseguo sempre da App Store, altri preferiscono usare combo update (questo per aggiornamenti di sistema)
Time Machine è ottimo, quindi backup li consiglio sempre
Puoi ripristinare completamente, oppure in caso di nuova installazione per esempio puoi importare, impostazioni, solo dati etc..
Tra un po' sposto questo topic nella sezione software, perché non tratta un argomento specifico per portatili ma un argomento generale, quindi le info contenute possono aiutare chiunque :)